Abdul Gani Kasuba lahir di Bibinoi, Maluku Utara, pada 21 Desember 1951. Ia merupakan putra dari pasangan Kasuba dan Hj. Siti Aisyah, yang keduanya berasal dari keluarga ulama.
Ayahnya adalah seorang guru agama yang mengajar di Madrasah Diniyah Awaliyah (MDA) Al-Khairat, sebuah lembaga pendidikan Islam yang didirikan oleh Syekh Abdul Karim Oyebola Amalatu, tokoh pendiri organisasi Al-Khairat.
Abdul Gani Kasuba mengikuti jejak ayahnya dengan menempuh pendidikan di MDA Al-Khairat sejak Sekolah Dasar (SD) hingga Madrasah Mualimin Al-Khairat (setingkat SMA).
Ia kemudian melanjutkan studinya di Fakultas Dakwah Universitas Islam Madinah, Arab Saudi, dan lulus pada tahun 1980.
Setelah kembali ke tanah air, Abdul Gani Kasuba mengabdikan diri sebagai pendidik dan aktivis dakwah. Ia menjadi Kepala Inspeksi Yayasan Al-Khairat dan mendirikan sekolah-sekolah di berbagai daerah terpencil di Maluku Utara hingga Papua.
Dia juga aktif dalam berbagai organisasi kemasyarakatan, seperti Majelis Ulama Indonesia (MUI), Dewan Masjid Indonesia (DMI), dan Forum Komunikasi Umat Beragama (FKUB).
Pada tahun 2004, Abdul Gani Kasuba memasuki dunia politik dengan menjadi anggota DPR RI dari Partai Keadilan Sejahtera (PKS). Ia duduk di Komisi VIII yang membidangi agama, sosial, dan pemberdayaan perempuan. Ia juga menjadi anggota Badan Legislasi (Baleg) DPR RI.
Empat tahun kemudian, ia mencalonkan diri sebagai Wakil Gubernur Maluku Utara mendampingi Thaib Armaiyn, yang diusung oleh Partai Golkar.
Pasangan ini berhasil memenangkan Pemilihan Kepala Daerah (Pilkada) 2008 dengan perolehan suara 37,77 persen.