Pepes ikan mas memiliki ciri khas rasa gurih yang berasal dari bumbu rempah-rempah yang meresap ke dalam daging ikan. Bumbu yang digunakan umumnya terdiri dari bawang merah, bawang putih, cabai, kunyit, jahe, lengkuas, serai, daun salam, dan daun jeruk. Penggunaan daun pisang sebagai pembungkus memberikan aroma khas yang menambah kelezatan pepes.
Keunikan pepes ikan mas terletak pada proses memasaknya yang dikukus. Cara ini memungkinkan bumbu meresap sempurna ke dalam daging ikan tanpa mengurangi kandungan nutrisinya. Pepes juga dikenal sebagai hidangan yang lebih sehat dibandingkan dengan hidangan yang digoreng.